1、首先對冷凍水干管進行沖洗：
當系統較大時，可采取分支系統分層沖洗的方法，沖洗前接好臨時沖洗管道，從頂層水平干管的末端逐層進行自上而下的沖洗，沖洗時關閉相鄰分支管上和風機盤管(或空調機組)的支管閥門，在總立管的底部接管至排水點或室外，進行自上而下的沖洗，直至排出水質清澈無泥砂為止。 　　
2、對冷凍站內的冷凍水管進行沖洗：
在沖洗前可在冷凍供回水管進入冷水機組的蒸發器閥門前加一臨時旁通管，將供回水管連通并安裝臨時旁通閥，將自來水接至集水器內進行管道沖洗。沖洗前關閉進入蒸發器管道的閥門，自來水通過旁通管進入分水器內，然后從分水器的排水管接臨時管道至附近地漏或室外，直至排水清澈為止。 　　
3、對冷卻水系統管道的沖洗： 　　
(1)首先應對冷卻塔進行沖洗：因冷卻塔在安裝和待運轉置放時。塔內的水槽、填料存有許多紙屑和泥砂等雜物。在運行前必須清理雜物然后進行水沖洗。沖洗前關閉進出水塔噴水管閥門。打開水槽的泄水閥，用自來水由上全下的對填料和水槽清洗，直至排出清澈無泥砂水為止。 　　
(2)對設有冷卻水循環水箱的冷卻系統沖洗：關閉進出冷水機組冷凝器的閥門，并在閥門前安裝一連接進出水骨的旁通管，旁通管上安裝旁通閥，利用冷卻水循環水泉進行循環清洗。
通過不斷的向循環水箱的補水和打開水箱排污管的不斷排放，逐漸將冷卻水循環管道(含冷卻塔)進行沖洗，合格后重新清洗水箱和除污器，拆除臨時旁通管，打開進出冷凝器的冷卻水閥門，待試運轉。